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由于前几天我看到公众号里的一篇文案是关于肿瘤基因高通量测序（简叫作：NGS）的检测时间，文件比较笼统的说了10天。其实我再以前的文案中亦提过一下。
此时间是病人、家属以及大夫都比较关心的一件事，因此我觉得有必要再做一下说明。在做说明前，我要说一下，我这儿说的是肿瘤用药基因检测的检测时间，包含高通量测序的检测时间，但不限于。
有那些原因会影响基因检测的完成时间？
我想大概有3个方面：
1、物流时间：亦便是样本从病人这儿到达检验所进入检测流程的时间。这是一个很要紧然则又容易被忽略的地区，正常状况通常是1-3天，然则遇到有些特殊状况，例如近期不可邮寄液体样本，或检验所所在地不可邮寄，此时候这个时间就会被没限拉长了。
2、检测时间：这个必须取决于检测流程以及所运用的检测办法。例如此刻的新冠病毒核酸的检测，运用的是荧光定量PCR，通常24小时之内就能够得到结果了。那篇公众号里的一篇文案针对NGS的检测时间给出了10天的说法，我觉得真是NGS，其实是越长越好。
3、重新检测时间：因为样本本身的原由以及操作过程中原由，倘若样本质检不合格，或最后的数据不合格，那就必须重新检测，这儿就会使原来的时间变长，倘若反复几次就欠好，通常检验所就会通告重新采样。
有那些原因会影响检测时间呢？
先简单说一下通常的检测流程：样本处理、检测过程、原始数据处理、人工复核以及报告出具
在这五个过程中，倘若质检都合格的话，样本处理、检测过程（不管运用什么检测办法，不同的检测办法会有不同，然则每种办法自己是比较固定的），人工复核以及报告出具这四个过程的时间是相对比较稳定的。
单独说一下检测过程，因为运用的检测办法不同，每种检测办法的时间是有一个比较稳定的时间的，例如荧光定量PCR上机大概就一个小时上下，例如NGS，从建库到上机到下数据，通常亦就3到4天。
这儿有三个会影响检测时间的地区：
第1：检测包含荧光定量PCR和NGS，都会有凑样本的状况，便是做一个实验有一个最基本的样本量，小于这个样本量他是不会做的。在有源源持续的样本时，这个不是问题，例如此刻新冠病毒的核酸检测。
第二：NGS的时间不同，重点在上机后到下数据这个时间，之因此有长短不同，重点是由于上机预设的数据量决定的，这个数据量和样本类型以及所做的Panel触及基因数量相关，倘若是组织样本，那相同Panel的状况下，必须的原始数据量就会比血液样本少非常多。
第三：结果验证，这个针对NGS以及其他检测都很要紧，例如做出一个阳性结果，然则这个结果又比较少见，这个时候处在对病人负责，应该是要再验证一下，这个可能就要上2-3天的时间。
针对NGS，对它检测时间影响最大的是数据分析的时间，这个时间取决于原始数据量的体积，这个原始数据量的体积和最后呈此刻报告的数据还不是完全相关的，亦便是说原始数据量大，分析时间长，然则出来的信息不必定多。我曾经遇到过一个数据跑了1星期的，数据出来的时候，我都快忘记还有这件事了。
我觉得比较恰当的检测时间，单纯的检测时间（不包含物流和重新检测时间）在10天相对是比较恰当的（亦便是一起始那个公众号的文案说到的时间，内心还是期盼越长越好），倘若只是几个基因的话，可能5天亦是能够的。还有倘若是游离血的样本，检测时间会相应的延长，这个是因为原始数据量会比很强。
怎样选取检测触及基因的数量？
从我上面的讲解能够看到，检测基因的数量亦便是Panel的体积直接影响到的检测时间。
针对平常肿瘤，我意见按平常基因来检测，乃至于能够只检测几个基因就可，例如肺癌，能够检测EGFR、ALK；胃肠道肿瘤，能够检测ERBB2、KRAS、NRAS、BRAF。针对罕见肿瘤，倘若吃不准的话，能够先不检测，由于罕见肿瘤非常多运用都是多靶点药品，这个不做基因检测问题亦不大。
然则针对所有的肿瘤，在时间和花费准许状况下，我都意见能够去尝试大Panel的NGS，这个针对病人道理会更大。
哪个时间点做检测最好？
这儿以外送检验所检测为例：
针对可切除的病人，倘若肿瘤的定性必须由病理结果决
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发表于 2024-6-26 09:48:38
