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越来越多的证据显示肿瘤浸润淋巴细胞的空间组织关系可能是肿瘤发展和治疗反应的重点决定原因。因此呢，绘制和分析精细的肿瘤免疫微环境结构可能为预测癌症预后供给新的见解。近期Cancer research杂志发布了一项探索性和前瞻性的临床科研，用来评定肿瘤微环境内的结构是不是能够预测头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的术后复发。该科研运用PhenoCycler-Fusion（PCF）空间单细胞蛋白组（原CODEX）检测了重点的免疫亚群。空间细胞邻域分析发掘了高频率的由CD31highCD38high 浆细胞构成的三级淋巴结构（TLS）与HNSCC术后复发率降低明显关联。
经过PCF空间单细胞蛋白组技术对来自9个病人的组织全片进行了30个抗体的检测，这些抗体能够识别重点的淋巴细胞亚群、肿瘤细胞、血管和基质细胞。质控之后对79万多个单细胞进行了定义，总共注释了20种细胞亚型，说明了肿瘤微环境繁杂的细胞构成。
空间关系分析定义了11个细胞邻域（cellular neighborhood, CN）。这些CN由不同的细胞类型构成，反映了不同细胞类型间在空间上存在繁杂的互作关系。
对每一个CN中细胞类型进行配对细胞-细胞互作分析（pairwise cell–cell contacts）发掘了有些CN中同源性互作占主导，有些CN中重点是异源性互做为主。异源性互作占比最多的是TLS1、TLS2和hot tumor 这3个CN。例如浆细胞主导了TLS1周边的细胞相互功效。这些细胞与其他浆细胞相互功效，还与CD90+ MSC-like细胞、血管细胞以及CD4+和CD8+T细胞相互功效。对比之前的科研说明TLS1或许相关好的预后。而在TLS2中，M2型巨噬细胞主导了相互功效，这些巨噬细胞与Treg、PMN-MDSC、CD4+和CD8+ T细胞相互功效，暗示了TLS2中或许与控制抗肿瘤免疫关联。
在hot tumor中，大约三分之一的肿瘤细胞与淋巴细胞亚群接触，例如中性粒细胞、CD4+ 和CD8 +T细胞，还有M2巨噬细胞和PMN-MDSC。相比之下，在cold tumor中，大都数肿瘤细胞是同类型的互作。
总之，这些CN对于肿瘤生长和免疫逃逸或有效抗肿瘤免疫的产生可能拥有要紧的功能。
临床关联性分析显示了细胞邻域TLS1在肿瘤未复发的病人中更为平常，高频率的TLS1与不复发显着关联，并且可预测没复发存活期。一样，组织浆细胞的占比与没复发关联，并预测没复发存活期。
蛋白定量分析发掘了TLS1中浆细胞表达更高的CD38和CD31，外边TCGA数据亦显示了更高的CD38和CD31转录水平与更好的疾患存活率明显关联。
总而言之，这项科研强调了PCF空间单细胞蛋白组在免疫监测中的功效，揭示了HNSCC 病人肿瘤微环境的反常繁杂性，再次说明了肿瘤微环境的空间组织结构针对细胞功能和预后至关要紧性，并发掘了TLS1 和CD31highCD38high浆细胞是肿瘤复发的要紧预测因子。
| PCF空间单细胞蛋白组学介绍
PCF采用oligo偶联抗体检测技术结合自动化高分辨荧光显微镜，可实现超多靶标的空间定位及单细胞分辨率下的细胞表型分析。所有抗体先一次性与组织切片结合，再起步抗体和荧光探针的“杂交 — 影像 — 剥离”三步循环，每次循环后经过荧光显微镜收集检测抗体的荧光信号。
| PCF空间单细胞蛋白组学优良
华盈生物PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间蛋白组学技术资格证书
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关联文献
Weed DT, Zilio S, McGee C, Marnissi B, Sargi Z, Franzmann E, Thomas G, Leibowitz J, Nicolli E, Arnold D, Bicciato S, Serafini P. The Tumor Immune Microenvironment Architecture Correlates with Risk of Recurrence in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma. Cancer Res. 2023;83(23):3886-3900.
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发表于 2024-6-22 16:03:47
