4月5日,国际顶尖学术期刊《细胞》及其子刊颁布了“癌症和肿瘤基因图谱”(TCGA)的“升级版”——泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的科研结果,关联结果以27篇高水平论文呈现,美国国家卫生科研院帮助的专家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,她们按照基因变异和表达的类似性,提出能够根据分子类型给癌症“归类”。科研人员认为,这将为癌症诊断和治疗供给新思路。
发布在美国《细胞》杂志上的科研,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约300种引起癌症的基因,并发掘已然获准的疗法覆盖了超过半数肿瘤病例的基因突变。
这项于2005年起步的“癌症基因组图谱”大型科研发掘,起源于同一细胞种类或属于同一系统的不同器官上出现的癌症,彼此之间存在类似性。
癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)早已为全世界广为知晓,这项计划于2005年提出,旨在经过基因组学分析技术,将人类所有癌症的基因组变异图谱绘制出来,从而更好地认识癌症出现和发展的机制。
尽管如今TCGA项目已然包括了33种最平常癌症且超过11000个肿瘤样本的测序等工作,然而,它还无完全结束。
▲TCGA的各项重要数据(照片来自CellPress)
科研人员举例说,头部、颈部、肺部、食道、膀胱和子宫颈的鳞状细胞癌拥有很强的分子类似性,可归为一类;胃癌、结肠癌和直肠癌等属于同一系统的癌症亦存在分子类似性。相反,有的癌症虽出现在同一器官,但可能属于完全不同的分子亚型,例如肾癌。
泛癌症图谱不仅侧重于对肿瘤基因测序数据的分析,同期亦对其他类型的数据,如蛋白组、临床以及影像方面的数据进行综合分析。
美国国立卫生科研院专家弗朗西斯•科林斯(Francis Collins)暗示,“该项目是过去进行了10数年的TCGA项目的巅峰之作,能让咱们精细找到肿瘤的出现原由,同期亦为将来的临床实验和治疗带来启示。”
►《细胞》杂志以封面重点介绍了这一系列科研
TCGA项目于2006年起步,历经10数年,该项目对全世界肿瘤科研产生了深远的影响。泛癌症图谱项目是TCGA项目的一部分,项目对来自11000个病例,33种不同癌症类型进行分析,从而能够告诉咱们人体的肿瘤出现、在哪里出现以及为何出现。
该项目由美国国立卫生科研院帮助,耗费高达3亿美元,由其下属的两个单位:国立人类基因组科研所(National Human Genome Research Institute)和国立癌症科研所(National Cancer Institute)一起来执行,大概有150名来自北美20余个高校院所的学者参与了该项目,其中亦不乏华人学者的身影。
TCGA数据重点是对肿瘤组织进行的基因测序数据,而泛癌症图谱项目则综合了各样组学数据,例如肿瘤的转录组、蛋白组、甲基化组学、临床以及影像方面的数据。
《细胞》杂志副主编Robert Kruger对这一科研能发在《细胞》及其子刊上颇为荣幸,并暗示,“泛癌症图谱如同人类癌症科研的谷歌地球。”
该项目共分为三大部分:肿瘤细胞的源自、肿瘤发展的过程以及信号通路。经过对肿瘤细胞源自的科研,科研人员发掘,细胞的源自并不完全决定肿瘤的归类,由此咱们必须重新审视肿瘤的分子分型。
论文一起作者、美国圣路易斯华盛顿大学科研人员丁莉说,针对有些癌症,以前咱们始终把它们当作完全不同的疾患进行治疗,而这是首次对33种癌症暗地里的遗传学原由进行汇总分析,归纳总结。
论文一起作者、美国北卡罗来纳大学教授查尔斯·佩鲁说:“分子水平上的新归类系统对临床有很大帮忙,能够解释不同部位肿瘤的某些类似的临床表现。”
美国巴克老龄化问题科研所肿瘤学家克里斯托弗·本茨说,癌症基因组图谱数据可为研发抗癌新疗法供给期盼,包含利用日前针对少许几种癌症效果明显的免疫疗法。
“此刻是重写癌症教科书的时候了,癌症归类出现了范式转换,要打破过去临床肿瘤学的桎梏。”本茨说。
转载|基因谷,美国推出癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)巅峰之作“泛癌症图谱”
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