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▎药明康德/报告
每位癌症病人的肿瘤都带有独特的基因突变，每一个突变都可能对肿瘤疾患发展和预后带来不同的影响。有的突变表率肿瘤更加恶性和富有侵袭性，而有的突变只会导致良性肿瘤，更好地认识病人的突变类型能够帮忙大夫寻找最佳的治疗方法。
近期，《科学》杂志发布了一项癌症基因组学的科研成果。瑞典专家们完成为了一项在癌症病人中的大型科研，她们经过超级计算机分析了17种平常癌症超过8000名病人的数据，创立了一个“人类癌症病理图谱”（Human Pathology Atlas），该图谱列出了数千个癌症关联的基因对病人存活的影响，以及潜在的新药品靶点。科研人员能够在网上公开拜访这些信息。
▲人类癌症病理图谱（照片源自：http://proteinatlas.org）
这个“人类癌症病理图谱”是多项正在进行中的对肿瘤公共数据库进行大数据分析的计划之一，这些数据库包含美国国家癌症科研所的肿瘤基因组图谱计划（National Cancer Institute’s Cancer Genome Atlas），它们收集了海量的癌症病人的基因组和临床信息。而研究人员期盼经过分析这些数据来帮忙研发更好的肿瘤诊断和治疗手段。
由Mathias Uhlen教授领导的来自瑞典皇家理工学院（Royal Institute of Technology in Sweden）的研究人员在科研中对8000多名病人的肿瘤样本进行了RNA测序和全转录组分析，亦便是分析了每一个基因所编码的蛋白在癌细胞中表达水平的变化。基因突变会增多或减少蛋白的表达量，而不同蛋白的表达量又有可能积极或消极地影响病人的存活率。
科研发掘，癌细胞中不同基因的表达量差异非常之大。同一种肿瘤不同病人中的差异乃至可能大于不同类型肿瘤之间的差异。这一现象强调了精细医学的要紧性。针对每位病人特有突变的个性化医疗方法可能会带来最佳的治疗效果。
这个团队还发掘了超过2000种可能影响病人存活率的基因。不外，这些基因的功效跟肿瘤类型和部位相关，有时候基因高表达对病人来讲是好信息，而有时候则寓意较差的预后。更要紧的是，她们并无发掘任何一个基因对所有不同类型的肿瘤病人都会造成影响。总的来讲，与细胞分裂关联的基因倘若表达量上升，病人的存活时间会缩短。而促进细胞分化的基因倘若表达量降低，亦常常与较低的存活率关联。
▲17种癌症中发掘对预后有利和有害的基因数目（照片源自：参考资料[2]）
另一，Uhlen教授团队找到了超过2000个能控制肿瘤的生长的基因，这些基因有可能作为新药开发的靶点。然则这些基因大多在正常组织中表达，靶向其中非常多基因亦可能带来许多副功效。最后，她们预测了32个潜在的跨肿瘤类型的药品靶点，这些基因的变化在超过80%的各样肿瘤病人中被发掘。
基因测序机构Illumina的肿瘤学副专家John Leite博士暗示，想要认识癌症的形成机制，并最后使科研人员和医生预测每位病人的最佳治疗方法，必须海量的生物学信息。这便是这个“图谱”能够帮上忙的地区。
参考资料：
[1] A Cancer “Atlas” to Predict How Patients Will Fare
[2] A pathology atlas of the human cancer transcriptome
[3] The Human Protein Atlas
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发表于 2024-6-22 05:05:59
