癌症是一大类疾患,其特征在于基因组中的突变或其他改变引起细胞生长不受掌控。肿瘤可显现数百至数千个突变,但仅有少许几个对其致瘤能力至关要紧。这些重要突变影响癌症驱动基因的功能。寻找拥有这种癌症驱动突变的基因是癌症科研的重点目的之一。
近期,西班牙巴塞罗那科学技术科研所的科研团队在 Nature Reviews Cancer杂志发布了题为:A compendium of mutational cancer driver genes 的论文。
经过对来自66种癌症的28076个肿瘤样本的基因组进行分析,鉴定了568个癌症驱动基因。这是迄今为止癌症驱动基因最完整全景图。日前该科研数据已在 IntOGen 平台更新。
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科研人员对来自66种癌症的28076个肿瘤样本进行了广泛的计算分析,并确定了568个癌症驱动基因。这些重要基因在调控细胞生长,细胞周期和DNA复制等方面起特定功效。
这些基因的突变赋予恶性细胞快速没休止繁殖,逃避免疫系统和其他防御系统,扩散和侵袭其他组织,以及为其自己利益而改变环境的能力。
经过鉴定这568种癌症驱动基因,科研人员观察到大都数基因拥有高度特异性,并且其突变仅能触发几种肿瘤类型。
然则,亦有一小部分癌症驱动基因功能强大, TP53
、 PIK3CA
、KMT2C、 ARID1A
、 KMT2D
、 LRP1B
、 PTEN
、RB1、FAT4、KRAS,这10个基因每一个的突变都能引起20多种不同类型的癌症,其中最夸张的便是大名鼎鼎的 TP53
基因,其突变引起的癌症超过50种。
尽管自从首次发掘癌症驱动基因败兴,科研人员就认识到了它们拥有不同程度的特异性,然则有了这个癌症驱动基因图谱,就能够没偏见地处理这个问题。
之前的科研显示,癌症平均由四种重要的癌症驱动基因平均导致。有些肿瘤仅由一种基因突变引起,而有些肿瘤,例如结直肠癌和子宫肿瘤等,10多种基因突变均可引起。
另外,其他基因组改变,例如结构突变、基因拷贝数改变以及基因组非编码区突变亦有助于肿瘤出现。
在癌症基因组学起始之前,专家们已然鉴定了几十个癌症驱动基因,这里后的二三十年里,专家们持续很如科研并表征了这些基因的功能。
而相比之下,在对第1个肿瘤基因组进行测序败兴不到二十年的时间里,专家们已然发掘了数百种癌症驱动基因。DNA测序技术的进步和生物信息学办法的发展,使得发掘癌症驱动基因的速度越来越快。这亦引起了癌症驱动基因的数量与人类已表征的癌症驱动基因数量之间存在了巨大的知识鸿沟。
这亦在必定程度上寓意着,尽快全面解析这568个癌症驱动基因驱动肿瘤出现发展,缩小这些知识鸿沟,是短期内癌症基因组学科研的重大挑战和奋斗方向。
该科研的领导者 Nuria Lopez-Bigas暗示:“癌症驱动基因汇编为临床和基本科研行业的癌症科研人员供给了至关要紧的知识,并且对临床决策拥有要紧影响。倘若咱们晓得肿瘤的致癌能力依赖于一种特定的蛋白质,那样科研人员就能够会采用经过准许的靶向疗法,例如抗体或其他阻碍其功能的控制剂来治疗癌症。”
该项目的领导者——Nuria Lopez-Bigas
参考链接:https://www.nature.com/articles/s41568-020-0290-xhttps://www.intogen.org/search
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