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这期咱们认识一下 TCGA 数据的癌种，以及简叫作，怎样快速准确的定位到指定的数据！
01数据库选取
咱们倘若想看数据信息，能够思虑 UCSC Xena (http://xenabrowser.net) ，在 hub 上能够看到各样类型的数据库，这儿咱们选取 TCGA Hub, 如下：
进入页面后，咱们发掘 TCGA 数据库上对应的癌种的全叫作以及缩写，如下：
02 TCGA的癌症名叫作，简写和中文名叫作
咱们看到 TCGA 数据上 38 Cohorts, 715 Datasets，那样我这儿给出 35 种癌种对应的中英文名叫作以及缩写，方便大众检索，以后对着列表找癌种就可，表格如下： 癌种缩写中文名叫作Adrenocortical CancerACC肾上腺皮质癌Bladder CancerBLCA膀胱尿路上皮癌Breast CancerBRCA乳腺浸润癌Cervical CancerCESC宫颈鳞癌和腺癌Bile Duct CancerCHOL胆管癌Colon CancerCOAD结肠癌Colon and Rectal CancerCOADREAD结直肠癌Large B-cell LymphomaDLBC弥漫性大B细胞淋巴瘤Esophageal CancerESCA食管癌FFPE Pilot Phase IIFPPPFFPE试点二期GlioblastomaGBM多形成性胶质细胞瘤lower grade glioma and glioblastomaGBMLGG胶质细胞瘤Head and Neck CancerHNSC头颈癌Kidney ChromophobeKICH肾嫌色细胞癌Kidney Clear Cell CarcinomaKIRC肾透明细胞癌Kidney Papillary Cell CarcinomaKIRP肾乳头状细胞癌Acute Myeloid LeukemiaLAML急性髓系白血病Lower Grade GliomaLGG脑低级别胶质瘤Liver CancerLIHC肝癌Lung AdenocarcinomaLUAD肺腺癌Lung CancerLUNG肺癌Lung Squamous Cell CarcinomaLUSC肺鳞状细胞癌MesotheliomaMESO间皮瘤Ovarian CancerOV卵巢癌Pancreatic CancerPAAD胰腺癌Pan-CancerPANCAN泛癌Pheochromocytoma & ParagangliomaPCPG嗜铬细胞瘤和副神经节瘤Prostate CancerPRAD前列腺癌Rectal CancerREAD直肠癌SarcomaSARC肉瘤MelanomaSKCM皮肤黑色素瘤Stomach CancerSTAD胃癌Testicular CancerTGCT睾丸癌Thyroid CancerTHCA甲状腺癌Thymoma (THYM)THYM胸腺瘤Endometrioid CancerUCEC子宫内膜样癌Uterine CarcinosarcomaUCS子宫癌肉瘤Ocular melanomasUVM眼部黑色素瘤这般就很清楚了，数据选取亦是文案起始的重中之重，您选对数据集了没？
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发表于 2024-6-27 15:31:36
